「生命科学とインターネット」リソースガイド

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以下の情報サイト案内は、神沼二眞、中野達也、生命科学とインターネット、オーム社、1997年10月発刊予定の内容に沿って整理されています。ご意見、お問い合わせはinternet@nihs.go.jpにお願いします。

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ミラーサイト


口絵

第1章 生命科学とコンピュータ

The Virtual Museum of Computing
The Alan Turing Home Page
The Retrocomputing Museum
EDSAC Simulator
Artificial Life
Implementation of the John von Neumann Universal Constructor
HPCC計画 (High Performance Computing and Communication Program)
National Institutes of Health (NIH)
United States Environmental Protection Agency (EPA)
National Library of Medicine (NLM)
The Visible Human Project

第2章 インターネットに接続する

World Wide Web Consortium
WWW (CERN)
MOSAIC
Netscape
首相官邸
官公庁 Web Server
NTT
OCN
ISDN
日本ネットワークインフォメーションセンター(JPNIC)
省際研究情報ネットワーク(IMnet)
IM-net Information

第3章 インターネットの利用環境を整える

Apache HTTP Server (Web Server)
Internet Software Consortium
BIND for NT(NT用DNS)
EMWAC IMS(NT用メールサーバ)
IMAP
Eudora
PGP国際版のホームページ(日本語版)
The International PGP Home Page
Yahoo
Java
Software Tools for Sequence Analysis
(うまくいかない場合は、Document EncodingをWestern(Latin1)に変更してください。)
Chemistry
VRML
VRML Repository
CERS

第4章 インターネット上の情報資源の利用

Dialog
STN
JICSTオンラインサービス
Netscape
Netscape(日本語)
Microsoft(日本語)
Microsoft Internet Explorer(日本語)
Microsoft (USA)
Microsoft Internet Explorer
WWW (CERN)
The National Center for Supercomputing Applications (NCSA)
COMPAQ(日本)
COMPAQ(USA)
DEC(日本)
DEC (USA)
DELL(日本)
DELL (USA)
GATEWAY2000(日本)
GATEWAY2000 (USA)
Hewlet Packard(日本)
Hewlet Packard (USA)
IBM(日本)
IBM (USA)
Intel(日本)
Intel (USA)
NEC(日本)
NEC (USA)
Novell(日本)
Novell (USA)
Silicon Graphics(日本)
Silicon Graphics (USA)
Cosmo Player
Apple(日本)
Apple (USA)
QuickTime
SUN(日本)
SUN (USA)
Patrick Douglas Crispen's Roadmap
インターネットによるインターネット講習会
Netscape ABOUT THE INTERNET
Netscape Net Search
NTT DIRECTORY
YAHOO!
Alta Vista
Galaxy
Infoseek
Lycos
Magellan
Excite
HotBot
Wave Search

CELLS alive!
Biologist's Control Panel

ゲノムネットWWWサーバ
国立医薬品食品衛生研究所 (NIHS)
科学技術振興事業団 (JST)
理化学研究所
国立がんセンター
国立がんセンター(実験用サーバー)
農林水産研究WWWサーバ
NLM
NCBI
NIH
Brookhaven National Laboratory
PDB
Johns Hopkins University
The Johns Hopkins University BioInformatics Web Server
GDB
Georgetown University
Washingyon University in St. Louis
Institute for Biomedical Computing
Stanford University
Baylor College of Medicine
Harvard University
Yale University
EMBL
EBI
Sanger Centre
Oxford University
ExPASy
SWISS-PROT
EasySEARCH

ForeFront
WebWhacker
CyberFinder
Harvest インターネット上の情報資源を収集する
GlimpseHTTP Home Pages
Library of Congress (USA)
JST
The Medline DatabaseCommunity of Science提供)
HealthGate MEDLINE +
SilverPlatter
Current Contents Search
BILANY CONSULTANTS
Reference Update
Chemical Abstracts Service (CAS)
Nature
Nature JAPAN
Science
Cell
Entrez
Protein Science
PROTEIN SCIENCE KINEMAGES
RasMol
MDL
Chemscape
Macromedia
Shockwave
Adobe
Acrobat
SAMBA
WEBゼミナール
マイ・ホームページへの道
Internet Assistant for Microsoft Word 95

第5章 コンピュータで生命の構造を探る

MRC
European Molecular Biology Laboratory (EMBL)
European Bioinformatics Institute (EBI)
ACEDB
LHASA
MDL
Chemscape
ISIS/Draw
CambridgeSoft
ChemDraw
SoftShell
ChemWeb
CCDC
CSD
Brookhaven National Laboratory
Protein Data Bank (PDB)
CCSD (CarbBank)
MacMolecule
RasMol
Protein Society
MAGE
Tripos
Molecular Inventor
Molcular Simulations Inc.
WebLab Viewer
NAOMI
MacroModel
Chemical Design
Chem-X
AVS
VRMLによる分子グラフィックス
MOLDA HOME PAGE Molecular Modeling and Graphics System using VRML Viewer
Virtual Reality Modeling Language in Chemistry
Java
Chemistry
MoleculeViewer (example 1) (うまく表示されない場合は、[View]-[Encoding]をWestern (ISO-8859-1)に変更してください。)

第6章 生体分子の配列情報

GenBank - National Center for Biotechnology Information
EMBL - European Bioinformatics Institute
DNA Data Bank of Japan (DDBJ)
GenomeNet WWW server
GDB JAPAN NODE JST
National Biomedical Research Foundation (NBRF)
The Protein Information Resource (PIR)
PIR-International
蛋白質研究奨励会
Nucleic Acid Database (NDB) Archive (Rutgers Univ. USA)
ExPASy
SWISS-PROT
PROSITE
Brookhaven National Laboratory
Protein Data Bank (PDB)
SCOP - Structural classification of proteins database
Department of Biochemistry and Molecular Biology University College London
Atlas of Protein Side-Chain Interactions
CATH (Class-Architecture-Topology-Homology)
Entrez
Genetics Computer Group (GCG)
Protein Structure Prediction Center
THREADER
National Human Genome Research Institute (NHGRI)
ACEDB
Agricultural Genome Information System
ACEDB WWW Servers -- NAL and Elsewhere
CBI研究会
虫の集い
NLM
NCBI
MMDB
NCSA Computational Biology
SDSC
The National Biomedical Computation Resource
The CMS Molecular Biology Resource
The CMS Molecular Biology Resource ミラーサイト(日本)
The Biocomputing Service Group at DKFZ
Integrated Genomic Database (IGD)
OMIM Home Page -- Online Mendelian Inheritance in Man

第7章 高次の構造へと組織化されていくデータと知識

Genera
ZOLAR
PharmWeb
ChemFinder Chemical Seraching and Information Integration
The WWW Chemical Structures Database
GLIMPSE
HotMolecBase
National Institutes of Health (NIH)
The CENTER FOR MOLECULAR MODELING (CMM)
The National Cancer Institute (NCI)
Developmental Therapeutics Program
Klotho: Biochemical Compounds Declarative Database
Moirai: Modeling Biochemistry
Washingyon University in St. Louis
Institute for Biomedical Computing
Center for Computational Biology
Department of Genetics
WashU-Merck Human EST Project
Department of Cellular and Molecular Pharmacology, Univ. of California, San Francisco
I.D. Kuntz Research Group
Pomona Colledge
MedChem/Biobyte QSAR database
Daylight Chemical Information Systems
NetPharmacology
National Institute for Occupational Safety and Health (NIOSH)
REGISTRY OF TOXIC EFFECTS OF CHEMICAL SUBSTANCES (RTECS)
National Institute of Environmental Health Sciences (NIEHS)
National Toxicology Program (NTP)
International Agency for Research on Cancer (IARC)
環境保健クライテリア (EHC) 日本語抄訳
国際化学物質安全性カード(ICSC)−日本語版−

第8章 生命の高次構造の記述

Enzyme Structures Database
KEGG: Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes
LIGAND Chemical Database for Enzyme Reactions
Health Computer Sciences, University of Minnesota
Biocatalysis/Biodegradation Database
PUMA
EcoCyc: Encyclopedia of E. coli Genes and Metabolism
Cell Signaling Networks Database
Signaling PAthway Database (SPAD)
Protein Kinase Resource (PKR)
G protein-coupled receptors (GPCRs)
Mutation Analysis of GPCRs.
GBF
TRANSFAC - The Transcription Factor Database
HotMolecBase
Stanford Genomic Resources
Saccharomyces Genome Database
Arabidopsis thaliana Database
Munich Information Centre for Protein Sequences (MIPS)
The Yeast Genome Project
Biosciences - WWW Virtual Library
The Drosophila Virtual Library
FlyBase
USA @ Harvard (http://cbbridges.harvard.edu:7081)
USA @ Indiana (http://flybase.bio.indiana.edu:82)
U.K. (http://www.embl-ebi.ac.uk/flybase)
France (http://astorg.u-strasbg.fr:7081)
Australia (http://www.angis.su.oz.au:7081)
Japan (http://shigen.lab.nig.ac.jp:7081)
Berkeley Drosophila Genome Project
FlyBrain
Freiburg, Germany.
Tucson, USA.
Tokyo, Japan
FlyView - A Drosophila Image Database
APLYSIA Hometank
Zebrafish Information Server
大阪大学細胞生体工学センター
BodyMap
CERS
NIH Image
The Visible Embryo
Neuroscience-Net
The WWW Virtual Library
Neuroscience
Neuroscape
Neurosciences on the Internet
A Tour of Neuroscience Web Sites
NeuroLinks
Human Brain Project

第9章 ネットワークで結ばれる研究者

JCRB Cell Bank
WDCM (国際培養生物保存連盟情報センター)
The Tree of Life
TreeBASE
Collaboratory for Microscopic Digital Anatomy (CMDA)
The National Center for Supercomputing Applications (NCSA)
Biology Workbench
アジェンダ21
Global Information Network on Chemicals (GINC)
The Global Health Network
Global Environmental Epidemiology Network (GEENET)
PharmWeb
PharmWeb(日本語版)

第10章 ネットワークが変える生命科学と社会との関係

付録

1 分子計算手法

The 1986 CODATA Recommended Values of the Fundamental Physical Constants
Summary of the 1986 recommended values of the fundamental physical constants
NIST WebBook
WebElements
CambridgeSoft
ChemDraw
MDL
Chemscape
ISIS/Draw
Molcular Simulations Inc. (MSI)
WebLab Viewer
Tripos
CONCORD
CORINA
Daylight Chemical Information Systems, Inc.
SMILES Home Page
GAMESS
PSI (CCQC)
MOLCAS
MOLPRO
EMSL Gaussian Basis Set Order Form
MOLPRO Basis Set Library
The MOLCAS basis sets
The Official Gaussian Home Page
About: GAUSSIAN 94 (Erlangen)
WAVEFUNCTION (Spartan)
Schroedinger. Inc.
HyperChem
CambridgeSoft
The PSI88 Molecular Orbital Plotting Package
gOpenMol
Advanced Visual systems
International AVS Centre (IAC)
株式会社ケイ・ジー・ティー
キャノン・スーバーコンピューティングS.I
MAVIS
AMBER
GROMOS
PVM (Parallel Virtual Machine)

2 生命情報(工)学の展望

3 インターネット上のサイト案内

Free software and share ware

  1. Genera
  2. RasMol
  3. Apache HTTP Server (Web Server)
  4. SAMBA

Commercial software

  1. Netscape Navigator
  2. WebSpace Navigator
  3. Sybase
  4. Oracle
  5. Access (Microsoft)
  6. 4th Dimension
  7. Paradox (Borland)

更新日:1997/09/19